HERVK 病毒RNA (左) 和病毒顆粒(RVLP,右) 在衰老人類細(xì)胞中聚集。 中科院動物所 供圖
中新網(wǎng)北京1月7日電 (記者 孫自法)人類數(shù)百萬年演化過程中整合進(jìn)入基因組中潛藏的古病毒,對人類健康特別是衰老有何影響?如何阻斷它們復(fù)活及擴散?這些關(guān)鍵科學(xué)問題一直以來亟待解決,也吸引科學(xué)家長期持續(xù)聚焦研究。
中國科學(xué)家團(tuán)隊對數(shù)百萬年前遠(yuǎn)古逆轉(zhuǎn)錄病毒入侵整合到人類基因組的遺跡——被譽為“古病毒化石”的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(ERV)最新完成一項合作研究,首次發(fā)現(xiàn)年輕的ERV亞家族在細(xì)胞衰老過程中被再度喚醒,他們提出古病毒復(fù)活介導(dǎo)衰老程序化及傳染性的理論,并且創(chuàng)新性發(fā)展出阻斷ERV古病毒復(fù)活及擴散以實現(xiàn)延緩衰老的多維干預(yù)策略。
(資料圖片)
這項人類基因組古病毒與衰老關(guān)系研究的重要成果論文,由中國科學(xué)院動物研究所劉光慧課題組、曲靜課題組和中科院北京基因組研究所張維綺課題組聯(lián)合中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所、北京干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究院、首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院、昆明理工大學(xué)、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、北京大學(xué)、北京醫(yī)院等共同完成,北京時間1月6日夜間在國際著名學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》(Cell)在線發(fā)表。
內(nèi)源性古病毒復(fù)活驅(qū)動衰老的機制與干預(yù)策略。 中科院動物所 供圖
探究古病毒元件是否參與衰老程序調(diào)控
合作團(tuán)隊介紹說,病毒與人類之間的協(xié)同進(jìn)化關(guān)系源遠(yuǎn)流長,它們之間的交鋒從未隨停止過,在這場曠日持久的“戰(zhàn)爭”中,一方面,病毒使人類飽受疾病困擾,甚至死亡,并在此過程中對人類基因組不斷利用與改造;另一方面,人類的免疫系統(tǒng)積極對抗病毒的入侵,使得整合到人類基因組中的病毒序列逐漸被宿主細(xì)胞的遺傳調(diào)控系統(tǒng)接管,協(xié)同進(jìn)化。
在百萬年的漫長歲月里,大量ERV的遺傳信息被人類細(xì)胞俘獲,并經(jīng)過突變、缺失等變異成為人類基因組中的“暗物質(zhì)”潛伏下來,占據(jù)人類基因組序列的8%左右,并成為重要的基因記憶。人類與ERV之間的較量可謂“魔高一尺道高一丈”,然而,在生命的孕育及演化中又貌似呈現(xiàn)出和諧共生的景象。
合作團(tuán)隊指出,衰老是人類慢性疾病的最大危險因素,其中,細(xì)胞衰老是機體衰老及各種衰老相關(guān)疾病發(fā)生發(fā)展的重要誘因,表觀遺傳的程序化改變被認(rèn)為是決定細(xì)胞衰老進(jìn)程的關(guān)鍵因素。人類基因組潛藏著諸多“老化”信號,這些衰老信息流通常受到表觀遺傳的嚴(yán)密調(diào)控而處于沉默狀態(tài),但在增齡過程中,由于表觀遺傳的失序,這些“老化”信號逃離管控,進(jìn)而激活啟動細(xì)胞內(nèi)的一系列衰老程序。
不過,占據(jù)人類基因組序列較大比例、如“死火山”般沉寂的ERV古病毒元件是否參與衰老的程序化調(diào)控尚且未知。沉睡在人類基因組中的ERV元件能否在衰老過程中逃脫宿主的監(jiān)視而被再度喚醒?這些“死火山”的蘇醒與爆發(fā)對細(xì)胞和組織的衰老有何影響?ERV古病毒的復(fù)活能否作為度量人類生物學(xué)年齡的標(biāo)志物以及干預(yù)衰老的分子靶標(biāo)?這一系列關(guān)鍵科學(xué)問題亟待解決,引發(fā)廣泛關(guān)注。
內(nèi)源性古病毒復(fù)活驅(qū)動開啟衰老“潘多拉魔盒”?!≈锌圃簞游锼?供圖
開發(fā)出有效抑制古病毒復(fù)活等干預(yù)策略
在本次研究中,合作團(tuán)隊利用建立的不同衰老研究體系,包括兒童早衰綜合征、成年早衰綜合征、復(fù)制性衰老、生理性衰老的人間充質(zhì)干細(xì)胞模型,人成纖維細(xì)胞衰老模型,以及小鼠、猴和人的生理性及病理性多器官衰老模型,結(jié)合高通量鏈特異性轉(zhuǎn)錄本測序、全基因組DNA(脫氧核糖核酸)甲基化測序、高分辨率單分子RNA(核糖核酸)原位雜交、免疫電鏡和高靈敏的液滴數(shù)字PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))等多學(xué)科交叉技術(shù),發(fā)現(xiàn)衰老細(xì)胞中表觀遺傳去抑制(如異染色質(zhì)減少)導(dǎo)致基因組中ERV的轉(zhuǎn)錄激活并翻譯出病毒蛋白,進(jìn)而包裝成為病毒顆粒。
研究發(fā)現(xiàn),一方面,衰老細(xì)胞中ERV的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物通過激活cGAS-STING(一種蛋白)天然免疫通路誘發(fā)細(xì)胞衰老和炎癥;另一方面,衰老細(xì)胞釋放的ERV病毒顆??赏ㄟ^旁分泌或體液介導(dǎo)的方式在器官、組織、細(xì)胞間有效傳遞并放大衰老信號,最終使得年輕細(xì)胞因受“感染”而老化。深入的機制研究表明,ERV反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物在宿主細(xì)胞胞漿中的出現(xiàn),會激活初始細(xì)胞及被感染細(xì)胞中固有的病毒防御機制。這種本能的細(xì)胞抗病毒反應(yīng)意在降低病毒的損害,然而事與愿違,這些防御性機制卻恰恰促進(jìn)了細(xì)胞的早衰。
基于此,研究團(tuán)隊詳細(xì)闡釋了衰老細(xì)胞基因組中ERV古病毒程序性復(fù)活、觸發(fā)細(xì)胞老化、借助病毒顆粒傳遞衰老信號、感染年輕細(xì)胞的全鏈條機制,又進(jìn)一步通過對ERV古病毒潛伏、復(fù)活、細(xì)胞間傳遞等不同生命周期環(huán)節(jié)的解析,他們開發(fā)出有效抑制ERV古病毒復(fù)活及清除病毒顆粒的干預(yù)策略,即通過發(fā)展基于靶向ERV調(diào)控元件的CRISPR(基因編輯技術(shù))基因沉默體系、靶向逆轉(zhuǎn)錄酶的小分子抑制藥物、靶向病毒包膜蛋白的中和抗體等技術(shù),阻斷ERV的轉(zhuǎn)錄、反轉(zhuǎn)錄、病毒級聯(lián)感染等多個環(huán)節(jié),進(jìn)而實現(xiàn)組織和機體衰老的延緩。
為衰老評估預(yù)警疾病防治提供線索思路
合作團(tuán)隊表示,他們最新完成的這項研究,系統(tǒng)定義并揭示衰老誘導(dǎo)的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒復(fù)活(AIR-ERV)可作為細(xì)胞、器官乃至機體衰老的驅(qū)動力及度量標(biāo)志物,為衰老的程序化、級聯(lián)放大和可干預(yù)性提供全新理論依據(jù),為人類衰老的科學(xué)評估和預(yù)警、衰老及衰老相關(guān)疾病的防治提供重要的線索和思路。
在理論方面,該研究創(chuàng)造性提出衰老的程序化、跨細(xì)胞傳遞及可干預(yù)性,將ERV古病毒的復(fù)活定義為新的衰老時鐘和驅(qū)動因素;在技術(shù)方面,此次研究綜合運用多維表觀基因組、轉(zhuǎn)錄靶向操控、單分子成像、病毒學(xué)、免疫學(xué)、化學(xué)生物學(xué)和分子病理學(xué)等前沿交叉技術(shù),動態(tài)捕獲ERV古病毒的復(fù)活、包裝、顆?;?、跨細(xì)胞傳遞和激活天然免疫通路等多個生物學(xué)過程,成功刻畫出ERV在衰老機體中的生命周期軌跡,開創(chuàng)出新的衰老研究范式;在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)方面,該研究以ERV古病毒復(fù)活鏈條的不同環(huán)節(jié)為靶標(biāo)發(fā)展出多樣化的衰老干預(yù)技術(shù),為衰老相關(guān)疾病的防治提供了新的策略,對衰老轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有潛在的應(yīng)用價值。
因此,本次研究揭示病毒密碼在遠(yuǎn)古時代便已融入人類的衰老及壽命調(diào)控程序,解碼基因組中的古病毒元素將有助于深刻理解人類衰老的機制、健康長壽的規(guī)律以及多種老年疾病的誘因。ERV古病毒的復(fù)活或許為認(rèn)識衰老的“潘多拉魔盒”提供一條嶄新的路徑,對魔盒的解讀可為理解衰老規(guī)律開辟新的科學(xué)疆域,更為防治老年疾病帶來全新希望。
合作團(tuán)隊認(rèn)為,在這次研究基礎(chǔ)上,未來圍繞伴隨衰老的ERV古病毒激活,將會涌現(xiàn)出更多的科學(xué)問題:ERV反轉(zhuǎn)錄本是否可以重新整合入宿主基因組,進(jìn)而介導(dǎo)衰老相關(guān)的基因組不穩(wěn)定性?ERV古病毒序列在人類基因組中是否具有遺傳多態(tài)性?是否與老年健康相關(guān)?ERV的復(fù)活和感染效率是否具有組織和細(xì)胞類型特異性?ERV激活是否會選擇性驅(qū)動特定衰老相關(guān)疾病的發(fā)生?體液中ERV檢測能否應(yīng)用于衰老和老年疾病的評估和預(yù)警?ERV生命周期的哪些靶向策略對于衰老和疾病干預(yù)最為有效?……他們期待隨著科學(xué)研究不斷深入和技術(shù)手段日益革新,這些問題將逐一得到解決。
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